魏氏密札言初八日步军统领衙门未能捕到林旭。对于林旭被捕的情况，《郑孝胥日记》中则有较为翔实的记述。

郑孝胥，字苏戡，又字太夷，与林旭（字暾谷）同为福建闽县人。郑氏晚年虽然追随清废帝溥仪到东北建立伪满洲国，沦为臭名昭著的汉奸，但在戊戌时期仍不失为一位思想开明的进步人士。政变发生前，郑孝胥因湖广总督张之洞保举经济特科而奉旨进京预备召见。他于七月初十日（8月26日）到达北京，寄寓福州会馆。郑氏抵京后，林旭频频造访，特别是七月十九日（9月4日）林旭被任命为军机章京后，曾向郑孝胥吐露了许多政情内幕。从《郑孝胥日记》中我们不仅可以了解林旭被捕前最后的活动痕迹，也可以看到一些涉及政变真相的珍贵史料，现将相关内容摘录如下：

七月廿三日（9月8日）暾谷来，余戒以慎口，勿泄枢廷事。

八月初五日（9月20日）返馆，幼陵（严复）、暾谷皆来，暾谷言，上势甚危，太后命新章京所签诸件，自今日悉呈太后览之。又言杨崇伊纠合数人请太后再训政，且以“清君侧”说合肥（指李鸿章），又以说荣禄。

八月初八日（9月23日）既寝，暾谷忽至，复起，谈良久，自言不得以康党相待。

八月初九日（9月23日）晨起作字。闻街市传言，有缇骑逮七人，即四军机章京，其三人未详。……（林）怡书来，言有官员至其宅，言礼王（世铎）传林旭面话，不及待车，步行而去。且云，宫中终夜扰动，发三电促荣禄来京矣。[7]

据林旭对郑孝胥言，八月初五日慈禧令将七月二十日以来“军机四卿”签拟诸件统统检出，由她重新审阅。这说明，慈禧已不能容忍新政再继续下去，并剥夺了光绪帝独立处理政务的权力。由皇帝超擢重用的“军机四卿”也开始受到冷遇。作为“围园”密谋的知情者，林旭已有惶惶自危之感。初八日深夜他与郑孝胥谈话时“自言不得以康党相待”，即是这种心情的流露。果然，初九日领班军机大臣礼亲王世铎令人至林怡书宅，“传林旭面话”。林旭“不及待车，步行而去”。此去即落入魔掌。林怡书（又作贻书）即林开謩，福建长乐人，与郑孝胥、林旭关系极密，时为翰林院编修。林旭被捕前一直“寄居开謩家”。[8]所以当他被带走后，林开謩立即赶至郑孝胥处通报消息。因此，“军机四卿”中林旭确系初九日被捕。《康南海自编年谱》言“林旭入直就缚”或许即指此事。